Bogemia Для зачисления справка не так важна.
Вопрос с зачислением у вас решен, вы числитесь, внесены в базу и сдавать будете.

Время решать вопрос о допуске. Произойдет он в мае, и специально писать заявление о зачете отметок не нужно, это Вы понимаете, потому что они сошлются на Приказ Минобрнауки России N 845, Минпросвещения России N 369 от 30.07.2020 Об утверждении Порядка зачета отметок. Не нужны нам такие формулировки.
Статья о 845 приказе тут

Нам нужно другое:
1. показать справку
2. получить их отношение устно - внесут оценки в личное дело или нет
3. если не берут - вот это ваш случай - то позвонить в УО и сказать -
"Мы перешли из одной школы в другую, у нас есть все оценки за год, нас зачислили в новую школу и внесли в базу ОГЭ, но заставляют по уже законченному 9 классу аттестоваться снова"
Либо:
"Мы перешли из одной школы в другую, у нас есть все оценки за год, нас зачислили в новую школу и внесли в базу ОГЭ, но заставляют аттестоваться по предметам не из обязательной части учебного плана".
4. на все возражения тыкать в Порядок заполнения аттестатов, который работает сейчас, где написано, что в аттестат СОшников вносятся оценки из обязательной части учебного плана.
5. больше ничего не обсуждать! На разводы не реагировать, слушать всё молча, кивать сочувственно, потом спрашивать - "так вы отказываете нам в проведении ОГЭ?" Или что еще там нарушено - "так вы настаиваете на сдаче предметов не из обязательной части", и получить ответ на вопрос - да или нет. Не заканчивать разговор, пока не ответят Да или Нет.

"Откажем" не будет сказано. Они попереживают, покричат, и велят школе принять оценки, как положено.

Есть еще одна вероятность - они могут не понимать, что Пенаты - аккредитованная школа.
На этом нужно акцентировать внимание.

Бывает, они никак не могут принять решение. Значит, им нужно, чтобы это решение за них приняло их начальство, они боятся ответственности. Нужно пойти ногами к заму повыше и проделать там это же.

Письма тут не нужны, нужно общаться по телефону, и если они согласны, то немедленно переговорят со школой. Если они этого не сделали - идти ногами, разговаривать лично.